在苏州市区单位搬迁的经办流程如下:由单位经办人携带营业执照、公章、变更登记通知书到转出地社保经办机构办理转出,填写《单位基本信息变更表》,再将表格带到新参保地社保经办机构确认信息,并需同步至税务和医保等部门办理相关手续。